Di masjid ini, Rasulullah صلى الله عليه وسلم memohon tiga hal kepada Allah. Dua permohonan dikabulkan, yaitu agar umat beliau tidak dibinasakan dengan bencana besar secara menyeluruh dan tidak dimusnahkan oleh musuh dari luar. Sementara satu permohonan lainnya, yaitu agar umat Islam tidak saling bermusuhan, menjadi ujian yang terjadi hingga akhir zaman.
Masjid Ijabah menjadi pengingat tentang kekuatan doa dan kasih sayang Rasulullah kepada umatnya. Beliau tidak hanya memikirkan keselamatan di dunia, tetapi juga masa depan dan persatuan umat Islam.
Keberadaan Masjid Ijabah mengajarkan umat Islam untuk memperbanyak doa, menjaga persatuan, dan menyadari bahwa doa adalah senjata utama orang beriman dalam menghadapi berbagai ujian kehidupan.